Laguna Honda mở cửa vào năm 1866 để chăm sóc một trong những thế hệ đầu tiên của người dân San Francisco, những người tiên phong trong cơn sốt vàng.  

Nhiều người đã đến miền Tây tìm kiếm vận may của mình trong các mỏ vàng và bạc ở Bắc California đã phá sản. Thành phố đang phát triển đã đáp ứng nhu cầu ngày càng tăng của những người cần giúp đỡ bằng cách xây dựng một tòa nhà khung gỗ bốn tầng để làm nơi ở cho những người dân San Francisco nghèo khó tại San Miguel Rancho cũ ở phía tây Twin Peaks. 

Trang trại này từng là tài sản của José de Noe, thị trưởng cuối cùng của San Francisco vào thời điểm thành phố này vẫn còn là một phần của Mexico. Đây là nơi lý tưởng để mọi người tự trồng trọt lương thực và chăn nuôi gia súc. Gần đó, trên vùng đất dốc phía sau Twin Peaks, một con suối tự nhiên cung cấp nước cho một đầm phá sâu, một đầm phá honda. 

Tòa nhà này được gọi là Nhà tế bần, cho đến thế kỷ 20, đây là thuật ngữ phổ biến để chỉ nơi trú ẩn dành cho những người mắc bệnh mãn tính hoặc nghèo đói không có nơi nào khác để đi.  

Giống như nhiều nơi như vậy, Almshouse tự trồng thực phẩm và gia súc trên 87 mẫu Anh đất nông nghiệp. Đến năm 1870, trang trại không chỉ nuôi sống hơn 500 người đàn ông, phụ nữ và trẻ em của Almshouse mà còn sản xuất ra một vụ thu hoạch dư thừa, đủ để chở vào thị trấn, cách đó ba dặm về phía đông bắc, để bán ở chợ.  

Có rất ít tiện nghi cho người dân của Nhà tế bần. Họ tự may quần áo và giày dép. Nhưng vào năm 1872, người quản lý đã báo cáo với các viên chức thành phố rằng “cùng với thức ăn, quần áo và sự sạch sẽ chung của nơi này [nó] ngang bằng, nếu không muốn nói là vượt trội, so với bất kỳ nơi nào có cùng bản chất ở Hoa Kỳ hoặc Châu Âu.” 

Các dịch vụ y tế đầu tiên được cung cấp vào năm 1868 khi thành phố mở một bệnh viện 24 giường trong thời kỳ dịch đậu mùa. Sau khi dịch bệnh lắng xuống vào năm 1870, bệnh viện đóng cửa và được thay thế bằng một nhà thương điên nhỏ. Giống như nhiều cơ sở như vậy trên khắp đất nước, Almshouse là nơi trú ẩn cho nhiều người sống ở bên lề xã hội. 

Khi thế kỷ kết thúc, các tòa nhà mới được xây dựng trên khuôn viên của Almshouse để phục vụ cho một nhóm dân số ngày càng đa dạng. Năm 1890, người quản lý báo cáo rằng cư dân của Almshouse đại diện cho khoảng bốn mươi quốc tịch khác nhau. 

Sự kiện quyết định của đầu thế kỷ mới là trận động đất và hỏa hoạn lớn năm 1906. Almshouse được đưa vào sử dụng để làm nơi ở và chăm sóc cho hàng ngàn người dân San Francisco phải di dời. Hiện được gọi là Relief Home, nơi này tập hợp các nạn nhân động đất đang sống trong các trại tị nạn rải rác khắp thành phố. Một tòa nhà kiểu gian hàng mới đã được xây dựng, có sức chứa 1.000 người. Tòa nhà được khánh thành vào năm 1909 bởi Tổng thống Theodore Roosevelt. 

Đến năm 1910, thành phố đã thêm một tòa nhà mới uy nghi khác vào Relief Home. Được gọi là Clarendon Hall, tòa nhà này có sức chứa 250 người và lần đầu tiên được dành riêng cho những người cần chăm sóc y tế dài hạn. Clarendon Hall đã bị phá hủy vào năm 2008 để nhường chỗ cho Laguna Honda ngày nay, một cơ sở có thể chịu được động đất mạnh hơn nhiều lần so với động đất khiến Clarendon được xây dựng. 

Sự chuyển dịch từ Relief Home sang cơ sở điều dưỡng lành nghề bắt đầu thực sự vào những năm 1920 khi Thị trưởng James “Sunny Jim” Rolph chuyển giao chiếc xẻng đất đầu tiên cho các tòa nhà theo phong cách Phục hưng Tây Ban Nha, sau này trở thành Bệnh viện và Trung tâm Phục hồi chức năng Laguna Honda 

Những tòa nhà này, với kiến trúc lát gạch Địa Trung Hải phản ánh kiến trúc của Laguna Honda ngày nay, được mở cửa vào năm 1926 và tiếp tục phát triển trong những thập kỷ tiếp theo với việc bổ sung thêm các "cánh ngón tay" mới, những khu mở dài theo phong cách Florence Nightingale vốn là thông lệ vào thời điểm đó. 

Vào những năm 1930, Laguna Honda trở thành trung tâm giảng dạy cho trường y khoa của Đại học California. Phẫu thuật bắt đầu được thực hiện và công nghệ chụp tim và chụp X-quang được giới thiệu. Lối vào tòa nhà chính được trang trí bằng những bức tranh tường WPA cổ điển hiện vẫn còn được trưng bày. 

Sau chiến tranh, Laguna Honda là nơi có chương trình nghiên cứu ung thư do Viện Ung thư Quốc gia và Đại học California tài trợ. Liệu pháp nghề nghiệp được giới thiệu với chương trình nghệ thuật kỹ thuật về dệt và đan rổ. Một căn phòng lớn được trang bị khung cửi được gọi là "phòng thảm", được đặt theo tên các sản phẩm được ca ngợi của những người thợ dệt tại đây. Chương trình đã phát triển thành một khoa trị liệu nghề nghiệp hoàn chỉnh vào năm 1953. 

Năm 1957, doanh nhân địa phương Gerald Simon đã thành lập Laguna Honda Volunteers, Inc., một tổ chức từ thiện cho đến ngày nay vẫn tài trợ các tiện nghi cho cư dân Laguna Honda như đồ dùng cá nhân, thiết bị hỗ trợ, sách, nhạc, các chuyến đi chơi và lễ kỷ niệm. Vào những năm 1960 và 1970, nhà hát Gerald Simon tại Laguna Honda là địa điểm biểu diễn của các nghệ sĩ như Bing Crosby, Merv Griffin, Eddie Fisher, Phil Harris, Donald O'Connor và Frankie Lane. 

Laguna Honda được công nhận là bệnh viện vào năm 1963 khi bệnh viện tiếp tục tái định hình theo cách có thể đáp ứng nhu cầu của nhóm đối tượng dịch vụ đa dạng. Các tòa nhà từ những năm 1920 đã trải qua một cuộc cải tạo lớn vào giữa những năm 70. 

Dựa trên nghiên cứu mới về tác động của môi trường xây dựng đến kết quả điều trị của bệnh nhân, nhóm lập kế hoạch từ Sở Y tế Công cộng và Công trình Công cộng San Francisco, liên doanh Anshen+Allen Architects và Stantec Architecture, cùng Trung tâm Thiết kế Y tế đã xây dựng ba tòa nhà mới trên khuôn viên rộng 62 mẫu Anh của Laguna Honda.  

Điểm cốt lõi của thiết kế là mục đích tạo ra nhiều lựa chọn cho cư dân Laguna Honda, giúp những người nhận dịch vụ chủ động trong việc chăm sóc bản thân, bao gồm đưa ra quyết định về các hoạt động cơ bản trong cuộc sống hàng ngày, chẳng hạn như ăn, ngủ hoặc lựa chọn thời điểm và địa điểm để tận hưởng sự giải trí và riêng tư. 

Ngoài việc tạo ra nhiều sự lựa chọn, các tòa nhà còn được thiết kế để thúc đẩy bầu không khí cộng đồng và tận dụng tác dụng chữa bệnh của môi trường tự nhiên Laguna Honda.  

Laguna Honda là bệnh viện đầu tiên được chứng nhận xanh của California. Chương trình Lãnh đạo về Thiết kế Năng lượng và Môi trường (LEED) của Hội đồng Xây dựng Xanh Hoa Kỳ đã trao chứng nhận bạc cho bệnh viện vào tháng 6 năm 2010.  

Ba tòa nhà của bệnh viện đều giải quyết các tác động đến môi trường trong thiết kế, xây dựng và vận hành theo sáu hạng mục được LEED chỉ định: địa điểm bền vững, hiệu quả sử dụng nước, năng lượng và khí quyển, vật liệu và tài nguyên, chất lượng môi trường trong nhà, quy trình đổi mới và thiết kế.

Gói tài trợ của Laguna Honda có điểm độc đáo là sử dụng 141 triệu đô la tiền doanh thu từ việc giải quyết các vụ kiện bảo vệ người tiêu dùng của thành phố do cựu luật sư thành phố Louise Renne đệ trình chống lại ngành công nghiệp thuốc lá vào cuối những năm 1990.     

Trong cuộc bầu cử thành phố năm 1999, cử tri thành phố đã chỉ đạo rằng doanh thu từ việc giải quyết thuốc lá sẽ được sử dụng để xây dựng một trung tâm điều dưỡng và phục hồi chức năng mới. Biện pháp bỏ phiếu, được gọi là Đề xuất A, đã được thông qua với 73% số phiếu bầu. 

Trái phiếu nghĩa vụ chung cung cấp 323 triệu đô la cho dự án, và việc thành phố bán chứng chỉ tham gia, một hình thức bảo đảm, cung cấp 120 triệu đô la còn lại với tổng chi phí là 584 triệu đô la. 

Lên đến 45% chi phí vốn của Laguna Honda đủ điều kiện được thanh toán bằng tiền liên bang theo Dự luật số 1128 của Thượng viện Tiểu bang California, do Thượng nghị sĩ tiểu bang lúc bấy giờ và hiện là Dân biểu Jackie Speier soạn thảo. Dự luật này cho phép thành phố nhận được khoản hoàn trả một phần từ liên bang cho chi phí xây dựng liên quan đến một số nâng cấp chống động đất liên quan đến chăm sóc sức khỏe.  

Trọng tâm trong sứ mệnh của Laguna Honda là sự tích hợp khuôn viên bệnh viện vào đời sống dân sự của thành phố.  

San Francisco nâng cao vẻ đẹp của không gian công cộng thông qua Sắc lệnh làm giàu nghệ thuật. Là một trong những sắc lệnh đầu tiên trong cả nước, sắc lệnh này quy định rằng 2% tổng chi phí xây dựng đủ điều kiện của các dự án công trình công cộng được phân bổ cho nghệ thuật công cộng.  

Chương trình Thay thế Laguna Honda đã tạo ra 3,9 triệu đô la tiền quỹ làm giàu nghệ thuật cho một chương trình nghệ thuật công cộng góp phần nâng cao chất lượng cuộc sống tại bệnh viện bằng cách giúp tạo ra một môi trường thẩm mỹ dễ chịu và cảm giác về nơi chốn và ngôi nhà. 

Mười tám nghệ sĩ được giao nhiệm vụ sáng tác các tác phẩm hỗ trợ nhu cầu lâm sàng và mục tiêu điều trị của bệnh viện. Các tác phẩm điêu khắc, tranh vẽ và tác phẩm đa phương tiện được lắp đặt khắp khuôn viên trường để hỗ trợ kích thích giác quan, tìm đường, khuyến khích hoạt động, tương tác với thiên nhiên và kích hoạt trí nhớ.  

Các tác phẩm có thể tiếp cận bằng xe lăn và xúc giác để cư dân có thể thưởng thức chúng khi gặp khó khăn về khả năng vận động và thị lực. Chúng cũng cung cấp một điểm đến mới cho những người yêu nghệ thuật ở San Francisco.